阿尔金山国家级自然保护区位于新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州若羌县境内，与青海和西藏相毗邻，位于东经87度10′-91度18′，北纬36o00′-37o49′，面积45000平方公里，平均海拔高度4600米以上。阿尔金山国家级自然保护区由新疆环保局负责管理，机构设在若羌县。保护对象为高原有蹄类动物，包括藏野驴、野牦牛、藏羚、藏原羚、盘羊、岩羊等，以及鸟类中的黑颈鹤、玉带海雕、藏雪鸡、暗腹雪鸡等。因无人烟而保持着原始的状态，有科学研究活动，1980年以来几乎每年都有国内外科学工作者在湖边扎营考察，但无固定设施。

阿尔金山国家级自然保护区内已发现高原植物267种，分属30科83属，新亚种17种。无乔木，只有半灌树，呈高原矮化特征。保护区内野生动物有359种。其中，有碲类30种，鸟类79种，昆虫250种(已发现新种2个)。国家一类保护动物12种、国家二类保护动物17种。阿尔金山国家级自然保护区内脊椎动物种爬行类有1种，兽类25种，高等植物27科96属241种以上，估算高原动物特有种野牦牛有2500头，藏野驴20000头，藏羚羊40000只左右。阿尔金山自然保护区分布的国家一级保护动物除野牦牛、藏野驴和藏羚羊外，还有雪豹、北山羊、黑颈鹤、胡兀鹫、玉带海雕及金雕;二级保护动物有马熊、石貂、猞猁、豺、兔狲、盘羊、岩羊、藏原羚、秃鹫、兀鹫、藏雪鸡、猎隼、红隼、棕尾鵟等二十余种，考察中还发现了多种昆虫和植物新种。